UCSF DOCK6.8对接教程之蛋白分子表面和受体空间准备

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DrugAI

发表于 2021/07/15 05:51:54

2021/07/15

【摘要】 UCSF DOCK6.8对接教程

        DOCK6 是UCSF  (加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接的软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请,申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。

DOCK6.8安装

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UCSF DOCK6.8对接教程

DOCK6 是UCSF (加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接的软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请,申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。

DOCK6.8安装

UCSF DOCK6.8对接教程之准备受体和配体文件:点击打开链接

准备蛋白质分子的表面文件(Chimera)

打开rec_noH.pdb,Action>Surface>showTools>Structure Editing>Write DMS ,保存为rec.dms

生成受体空间(DOCK6.8)

将INSPH文件放入对接文件夹;

INSPH

rec.dms

R

X

0.0

4.0

1.4

rec.sph

终端输入sphgen,生成OUTSPH和rec.sph

文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/78555962

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